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西安交大科研人员开发微卫星不稳定性
检测
新方法,助力肿瘤精准
检测
微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, 简称MSI)是目前肿瘤临床检测中一种非常重要的分子表型,多发生于结直肠癌、胃癌、和子宫内膜癌。微卫星不稳定性与肿瘤的发生、发展,治疗方案制定及治疗效果预测相关,更是肿瘤免疫治疗疗效预测的重要分子标记物。当前,临床上使用的两种微卫星不稳定性检测的金标准方法:MSI-PCR和MSI-IHC,都需要专业技术人员通过实验操作来完成,均费时费力且成本较高。近年来,随着高通量测序(Next Generation Sequencing)的发展,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方法开始显露头角,在检测结果与两种临床金标准保持高度一致的情况下,极大的缩减了检测时间并减少了检测成本,大幅提高了推广微卫星不稳定性检测的可行性。2014年,西安交大叶凯教授团队率先开发了基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方案——MSIsensor。2017年该检测方案作为全世界首个泛肿瘤检测方案MSK-IMPACT中的微卫星不稳定性计算方法,通过了美国食品药品监督管理局的严格测试并获得批准。美国纪念斯隆凯特琳癌症中心测试表明,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测与金标准的一致性可达99.4%。然而,微卫星不稳定性检测方案大都要求提供病人的癌症组织样本及一份取自血液或者癌症组织附近的正常样本。一方面,这一份正常对照样本限制了微卫星不稳定性的应用场景,尤其难以应用于血癌样本、福尔马林包埋样本、PDX/PDO等不易获得正常对照样本的情况;另一方面,额外的对照样本增加了微卫星不稳定性的检测成本。基于上述原因,在叶凯指导下,叶凯青年科学家工作室科研人员经过两年的探索,从微卫星不稳定性发生机理出发,通过数学模型抽象,从单个肿瘤样本中提取特征,开发了MSIsensor-pro。MSIsensor-pro实现不依赖正常对照样本的微卫星不稳定性检测,只需50个微卫星位点的测序数据即可实现微卫星不稳定性的精准检测。MSIsensor-pro的开发扩大了微卫星不稳定性的应用范围,减低了微卫星不稳定性检测的成本。同时MSIsensor-pro在低肿瘤纯度和低测序深度这类低信噪比数据中也显示出来很大的潜力。 该研究成果近期发表在国际组学和生物信息学领域权威期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》(影响因子6.597)上。叶凯的博士生贾鹏为该论文的第一作者,叶凯为通讯作者,西安交通大学为本文唯一通讯作者单位。这是叶凯教授课题组在基因组暗物质解析方面的又一重要突破。论文链接为:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022920300218
西安交通大学
2021-04-10
一种应用于地形模型
风
场特性风洞试验的三维渐变式边界过渡装置
成果描述:本发明公开了一种应用于地形模型风场特性风洞试验的三维渐变式边界过渡装置。所述边界过渡装置主要由多个节段串联拼接而成,每一节段包括两块侧板以及面层;每块侧板具有竖边、底边和曲边;两块侧板的曲边上固定铺设所述面层;所述侧板的竖边高度等于地形模型边界对应位置处的高度;所述侧板的底边长度为风洞宽度的5%-8%,且所述侧板的竖边与底边所形成的坡度在20°-40°;所述侧板的曲边线形由方程确定,其中x代表曲边的径向位置,y代表曲边的竖向位置,参数r与m由方程组确定,式中h0为竖边的高度,k0为竖边高度与底边长度之比。本发明能使气流过渡后其风场特性满足要求的前提下,对风洞空间要求低,适用性强。市场前景分析:轨道交通基础设施建设领域。与同类成果相比的优势分析:技术先进,性价比较高。
西南交通大学
2021-04-10
一种应用于地形模型
风
场特性风洞试验的三维渐变式边界过渡装置
本发明公开了一种应用于地形模型风场特性风洞试验的三维渐变式边界过渡装置。所述边界过渡装置主要由多个节段串联拼接而成,每一节段包括两块侧板以及面层;每块侧板具有竖边、底边和曲边;两块侧板的曲边上固定铺设所述面层;所述侧板的竖边高度等于地形模型边界对应位置处的高度;所述侧板的底边长度为风洞宽度的5%-8%,且所述侧板的竖边与底边所形成的坡度在20°-40°;所述侧板的曲边线形由方程确定,其中x代表曲边的径向位置,y代表曲边的竖向位置,参数r与m由方程组确定,式中h0为竖边的高度,k0为竖边高度与底边长度之比。本发明能使气流过渡后其风场特性满足要求的前提下,对风洞空间要求低,适用性强。
西南交通大学
2018-09-19
一种含
风
电的三相不平衡配电网的静态电压稳定性评估方法
本发明公开了一种含风电的三相不平衡配电网的静态电压稳定 性评估方法,包括获取配电网系统参数以及接入配电网的风电参数; 含风电的配电网系统的负荷增长因子 LSF 的初始值为 1,根据配电网 系统参数和风电参数获得含风电的配电网系统在当前 LSF 下的潮流, 并判断潮流是否收敛,若是,则获得配电网各个节点的电压幅值、相 角以及各支路末端的传输功率,若否则配电网失去静态电压稳定性; 根据含风电的配电网的潮流计算结果获得各支路的静态电压稳定指 标;根据各支路的静态电压稳定指标获得全网的静态电压稳定指标和 稳
华中科技大学
2021-04-14
一种适用于大尺寸薄壁高强度
风
电轮毂的铸铁材料及其制备方法和应用
本发明公开了一种适用于大尺寸薄壁高强度风电轮毂的铸铁材料及其制备方法和应用,属于材料及铸造工艺技术领域,本发明通过优化合金成分设计,结合微量稀有金属元素钡(Ba)、锑(Sb)、铋(Bi)和稀土元素(RE)的协同作用,以及通过添加三相SiC/SiO<subgt;2</subgt;/TiC纳米颗粒增强相,抑制珠光体形成并细化石墨球,使球化率≥95%、铁素体含量≥90%。通过添加纳米颗粒增强相,控制Ni≤0.8%等合金元素比例,进一步提高材料的耐蚀性。以及智能控温控冷铸造工艺,制备出具有高球化率、优异力学性能、耐低温冲击性和耐腐蚀性的球墨铸铁材料,满足18MW级海上风电轮毂轻量化、高强度、耐腐蚀和高可靠性的需求。
南京工程学院
2021-01-12
一种用于等温扩增
检测
结核分枝杆菌的引物及包含该引物的
检测
试剂和方法
本发明公开了一种用于等温扩增检测结核分枝杆菌的引物及包含该引物的检测试剂和方法,所述引物包括上游序列和下游序列,其序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;包含该引物的检测试剂包括上游引物85BPF1、下游引物85BPR1和探针85BPB1(SEQ ID NO:3);利用所述检测试剂等温扩增检测结核分枝杆菌的方法,包括以下步骤:将待检测基因样本与所述检测试剂混合,放置在可收集FAM荧光的仪器中,在35?45℃条件下孵育,检测荧光值,根据有无阳性扩增反应,判断待检测基因样本是否属于结核分枝杆菌的基因。相对于现有技术,本发明通过检测结核杆菌中的基因组,可以特异地检测结核杆菌基因,能够有效区分结核分枝杆菌和非结核分支杆菌,特异性高,反应时间短,温度过程简单。
东南大学
2021-04-11
一种基于(Ti,M)(C,N)固溶体
粉
的弱芯环结构新型金属陶瓷材料
一种基于(Ti,M)(C,N)固溶体粉的弱芯环结构新型金属陶瓷材料,其原料组分及各组分的重量百分数为10~20%的Co或/和Ni粉末,10~35%的第二类碳化物粉末和余量的(Ti,M)(C,N)固溶体粉,所述(Ti,M)(C,N)固溶体粉中M为W、Mo、V、Cr、Ta、Nb中的至少一种,所述第二类碳化物为WC、VxC(0
四川大学
2021-04-11
面向APT
检测
的攻击链数据建模与分析
主要研究APT 网络攻击全链条的通用表征和威胁模型, 实现攻击的全链条威胁分析;研究跨平台内核数据实时可信 采集方法,探索基于去噪和去冗技术的高效数据解析、基于 语义恢复技术的关键字段填充;研究多源异构内核数据的重 构方法;研究保持全局依赖的数据压缩方法,实现实时、高 效、普适的数据压缩;研究面向APT网络攻击全链条的智能 检测框架,实现对攻击的全链条高效检测;研究APT网络攻 击的演化模式,实现APT网络攻击的可解释溯源分析。
浙江工业大学
2021-05-06
新型新冠肺炎快速
检测
试剂盒
天津大学生命科学学院黄金海教授和叶升教授团队瞄准临床实践所需,制定了病毒、抗体快速诊断以及生物防治制剂的研发方案。团队迅速制备获得新型冠状病毒高纯度蛋白,并与北京华科泰生物技术股份有限公司联合完成免疫荧光层析试纸条检测病毒抗原灵敏性、交叉性等实验,成功研发出新型冠状病毒抗原荧光免疫层析快速检测试剂盒。与目前临床使用的检测试剂盒相比,新型试剂盒最大的优势是“快”,可在15分钟内检测出是否为新型冠状病毒,极大地缩短了检测时间;同时该试剂盒具有高灵敏度,病毒蛋白检测达到pg级,为病毒感染的早期筛查提供了简便灵敏的手段。实验结果显示,新型试剂盒检测限、灵敏度、线性系数等性能指标均满足对病毒抗原检测的有效性要求。新型试剂盒正在加紧临床验证,在获得相关部门检验审批后有望用于疫情的快速检测和早期诊断,缩短疑似病例的筛查时间,助力新冠病毒疫情的防控。天津大学生命科学学院科研团队正在加紧进行新型冠状病毒早期感染抗体检测、新型生物防治制剂的研发工作,目前进展顺利,有望近期取得可用性成果。
天津大学
2021-04-10
新型冠状病毒核酸
检测
试剂盒
沈阳化工大学特聘教授尹秀山团队成功研制出“新型冠状病毒核酸检测试剂盒”,已投入科研使用。本次研发为沈阳市科技局会同辽宁省科技厅联合启动的首批冠状病毒感染的肺炎疫情应急科研攻关项目,包括新型冠状病毒的快速检测试剂盒、家用试剂盒及配套产品等,用于疑似病例早期初步筛查。
沈阳化工大学
2021-04-10
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